Klub osnovan 1904. godine kao "Društvo za učenje i zabavu". Poznat kao AC Siena postao je 1933./34. godine. 1934./35. Siena je promovisana u seriji B. Nakon 55 godina igranja u sporednim ligama, Siena 1999. godine ponovo postaje član B serije. Posle dobre sezone 2000./2001. Siena zapada u ozbiljne probleme, ali zahvaljujuci treneru Đuzepu Papadopolu, se izvlaci poslednjeg dana.

Naredne sezone, na čelu sa Papadopulom, Sena napokon prelazi u seriju A, zahvaljujuci Rodrigu Tadei i Pingu. 2003./2004. klub zavrsava na dobrom za njih 13-om mestu, ali vec naredna sezona za njih je bila borba za opstanak koju su jedva dobili, završivši na 14-om mestu.

Sezonu 2005.-2006. završili su na 17-om mestu, po poslednji put na čelu sa trenerom De Kanio.