Prema odluci Fudbalskog saveza Srbije od 29. juna 2006. liga broji 12 klubova. Od sezone 2008/2009, zvaničnim potpisivanjem ugovora Fudbalskog saveza Srbije i Apatinske pivare, liga nosi naziv Jelen Super Liga.

Do sezone 2006/07, prvenstvo je bilo organizovano u 32 kola i sprovodilo se u dva dela. U prvom delu su se 22 utakmice igrale po dvostrukom bod sistemu (11+11). U drugom delu se igralo 10 kola (5+5) za nadigravanje gde su klubovi koji bi zauzeli mesta od 1. do 6. igrali za prvaka Supelige i plasman u UEFA takmičenja, a klubovi od 7. do 12. mesta – za opstanak u ligi.

Od sezone 2007/08, liga se igra po trokružnom sistemu.

Šampioni Jelen Super Lige

Prvenstvo SR Jugoslavije

• 1992/93 - Partizan
• 1993/94 - Partizan
• 1994/95 - Crvena zvezda
• 1995/96 - Partizan
• 1996/97 - Partizan
• 1997/98 - Obilić
• 1998/99 - Partizan
• 1999/00 - Crvena zvezda
• 2000/01 - Crvena zvezda
• 2001/02 - Partizan
• 2002/03 - Partizan

Prvenstvo Srbije i Crne Gore

• 2003/04 - Crvena zvezda
• 2004/05 - Partizan
• 2005/06 - Crvena zvezda

Prvenstvo Srbije

• 2006/07 - Crvena zvezda
• 2007/08 - Partizan
• 2008/09 - Partizan